河南农业科学 ›› 2014, Vol. 43 ›› Issue (3): 128-132.

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家猪TBP蛋白结构与理化性质的生物信息学分析

胡慧艳1贾青1,2*,陶 隽1, 魏星灿1,陶文欢1,墨锋涛1,邢增喜1   

  1. 1.河北农业大学 动物科技学院,河北 保定 071001;2.国家北方山区农业工程技术研究中心,河北 保定 071001
  • 收稿日期:2013-10-22 出版日期:2014-03-15 发布日期:2014-03-15
  • 通讯作者: 贾青(1964-),男,河北河间人,教授,博士,主要从事动物遗传育种研究。E-mail:jiaqing@hebau.edu.cn
  • 作者简介:胡慧艳(1989-),女,河北灵寿人,在读硕士研究生,研究方向:动物遗传育种与繁殖。E-mail:huhuiyan315@163.com

  • Received:2013-10-22 Published:2014-03-15 Online:2014-03-15

摘要: TBP是真核生物的通用转录因子,在转录过程中扮演着重要的角色。采用生物信息学方法鉴定了家猪TBP蛋白家族成员,对家猪TBP蛋白进行染色体定位、理化性质和系统进化分析,并对其二级和三级结构进行预测。结果显示,家猪TBP蛋白家族包含3个成员,染色体定位发现其中2个TBP基因分布在第1染色体上,另1个位于骨架上;3个TBP蛋白家族成员的氨基酸数目分别为188、273、376,其中1个为疏水性蛋白、2个为亲水性蛋白;TBP蛋白二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主要组成部分,其家族成员的三级结构基本相似。 

关键词: 家猪, TBP, 蛋白家族, 生物信息学分析