大白菜Indel-PCR反应体系的优化

河南农业科学 ›› 2012, Vol. 41 ›› Issue (9): 110-113.

大白菜Indel-PCR反应体系的优化

梁爽^1,2，原玉香²，张晓伟^2*，薛银鸽¹，姚秋菊²，蒋武生²，田保明¹，张强²，赵艳艳²

1.郑州大学生物工程系，河南郑州 450000；2.河南省农业科学院园艺研究所，河南郑州 450002

收稿日期:2012-05-30 出版日期:2012-09-15 发布日期:2012-09-15
通讯作者: 张晓伟（1965-），男，河南平舆人，研究员，主要从事蔬菜生物技术育种研究。E-mail：xiaowei5737@163.com
作者简介:梁爽（1987-），女，河南新乡人，在读硕士研究生，研究方向：十字花科蔬菜生物技术。E-mail：shuang871118@yahoo.com.cn
基金资助:
国家大宗蔬菜产业技术体系(CARS-25-G-27);农业部黄淮地区蔬菜科学观测实验站(河南)(10205020);河南省科技创新杰出青年(124100510018);河南省农科院财政预算专项基金(2012-15)

Received:2012-05-30 Published:2012-09-15 Online:2012-09-15

摘要/Abstract

摘要： 采用CTAB法提取大白菜基因组DNA,利用单因素试验对InDel-PCR反应体系中的dNTPs浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶用量、模板DNA用量、引物浓度、退火温度、三温循环时间等7个因素进行筛选和优化。结果表明,适用于大白菜InDel-PCR分析的最佳扩增条件为(20μL):dNTPs 0.1mmol/L、Mg2+1.5mmol/L、Taq DNA聚合酶0.4U、模板DNA 105ng、引物浓度0.4μmol/L、退火温度50℃、三温循环时间30s-30s-45s。该体系可用于大白菜遗传多样性分析及遗传图谱构建。

关键词: 大白菜, InDel, PCR, 条件优化

梁爽，原玉香，张晓伟，薛银鸽，姚秋菊，蒋武生，田保明，张强，赵艳艳. 大白菜Indel-PCR反应体系的优化[J]. 河南农业科学, 2012, 41(9): 110-113.

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