河南农业科学 ›› 2014, Vol. 43 ›› Issue (8): 14-19.

• 作物栽培 遗传育种 • 上一篇    下一篇

玉米ZmHDR基因的分子克隆及生物信息学分析

鲁晓民,王振华,张新,张前进,魏昕   

  1. 河南省农科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002
  • 收稿日期:2014-02-08 出版日期:2014-08-15 发布日期:2014-08-15
  • 作者简介:鲁晓民(1980-),男,河南许昌人,助理研究员,博士,主要从事玉米遗传育种。E-mail: luxiaomin2004@163.com
  • 基金资助:
    转基因生物新品种培育重大专项课题(2008ZX08003-004

  • Received:2014-02-08 Published:2014-08-15 Online:2014-08-15

摘要: 为了解ZmHDR在玉米叶绿体发育过程中的作用机制及进化模式,利用RT-PCR方法克隆了玉米HDR基因,并对其进行了生物信息学分析。结果表明,ZmHDR基因在玉米基因组中以单拷贝形式存在,全长序列为3 188bp,其中含有1 389bp的开放阅读框,编码1个由462个氨基酸组成的蛋白;半定量PCR分析表明,该基因是一个组成型表达的基因;不同物种氨基酸序列比对结果显示,ZmHDR基因与高粱、水稻、黄花蒿、烟草、三叶胶、孜然芹、拟南芥、青色藻同源性比较高,暗示该基因在进化上具有高度的保守性。 

关键词: 玉米, ZmHDR基因, RT-PCR, 生物信息学分析