河南农业科学 ›› 2015, Vol. 44 ›› Issue (3): 148-151.

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猪博卡病毒NP1基因的克隆及其生物信息学分析

郑英帅,左奕,柴瑞影,戚妍,李雅楠,袁万哲,孙继国*   

  1. 河北农业大学 动物医学院,河北 保定 071001
  • 收稿日期:2014-10-22 出版日期:2015-03-15 发布日期:2015-03-15
  • 通讯作者: 孙继国(1957-),男,河北衡水人,教授,博士生导师,主要从事新型生物制品研究。E-mail:sunjiguo2000@aliyun.com
  • 作者简介:郑英帅(1988-),男,河北邢台人,在读硕士研究生,研究方向:预防兽医学。E-mail:zhengyewun@163.com
  • 基金资助:
     

  • Received:2014-10-22 Published:2015-03-15 Online:2015-03-15

摘要:  根据Gen Bank发表的猪博卡病毒主要抗原基因NP1基因设计1对引物,采用降落PCR方法进行扩增,克隆后测序,并对该基因进行生物信息学分析。结果表明:成功克隆到猪博卡病毒NP1基因;NP1蛋白的二级结构中自由卷曲含量最高(51.77%),无跨膜蛋白,含有1个糖基化位点、30个磷酸化位点,有6个线性B细胞优势抗原表位,分别位于NP1蛋白的7—14位、27—50位、59—73位、85—94位、102—108位、151—155位。 

关键词: 猪博卡病毒, NP1基因, 克隆, 生物信息学分析