河南农业科学 ›› 2014, Vol. 43 ›› Issue (5): 172-175.

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不同物种Mchr1基因编码区生物信息学分析

  马梦云,李祥龙*,周荣艳,李兰会   

  1. 河北农业大学 动物科技学院,河北 保定 071001
  • 收稿日期:2013-12-16 出版日期:2014-05-15 发布日期:2014-05-15
  • 通讯作者: 李祥龙(1963-),男,河北丰南人,教授,博士,主要从事动物遗传育种研究。E-mail:lixianglongcn@yahoo.com
  • 作者简介:马梦云(1989-),女,河北无极人,在读硕士研究生,研究方向:动物遗传育种。E-mail:mamengyun125@163.com
  • 基金资助:
    国家自然科学基金(31172196)

  • Received:2013-12-16 Published:2014-05-15 Online:2014-05-15

摘要: 采用比较基因组学和生物信息学的方法分析了人、黑猩猩、玻利维亚灰鼠猴、猕猴、蒙眼貂、裸鼢鼠、佛罗里达海牛、小家鼠、小马岛猬共9个物种的黑色素浓集激素受体1(Mchr1)基因编码区(CDS)的遗传多样性,并对其氨基酸序列、蛋白结构等进行预测。结果表明,来自9个物种的44个Mchr1基因序列中共检测到多态位点200个,其中单一多态位点81个,单倍型14种,Mchr1基因CDS在种内表现较为保守,种间则表现出较丰富的遗传多样性。Mchr1蛋白为疏水性蛋白,理论等电点均大于7,肽链的不稳定系数介于36.26~44.21,均较稳定。Mchr1蛋白位于细胞质中。

关键词: Mchr1基因, 编码区, 生物信息学, 遗传多样性