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Fusarium graminearum sensu stricto和F. asiaticum 3种分子鉴定方法的比较

  

  1. (河南省农业科学院 植物保护研究所/农业部华北南部作物有害生物综合治理重点实验室/河南省农作物病虫害防治重点实验室,河南 郑州 450002)
  • 收稿日期:2017-04-13 出版日期:2017-11-15 发布日期:2017-11-15
  • 通讯作者: 郝俊杰(1978-),男,河南登封人,副研究员,博士,主要从事玉米病害研究。
  • 作者简介:茹艳艳(1986-),女,河南洛阳人,助理研究员,博士,主要从事玉米病害研究。
  • 基金资助:
    河南省农业科学院科研发展专项资金项目(201412008,豫财预[2017]76-11);河南省农业科学院自主创新专项基金项目(2017ZC38)

  • Received:2017-04-13 Published:2017-11-15 Online:2017-11-15

摘要: Fusarium graminearum sensu stricto和F. asiaticum是中国主要的禾谷镰刀菌复合种(FGSC)成员,为了提高这2个种的鉴定效率,选取48个引起小麦赤霉病和玉米茎腐病的FGSC菌株,比较了系统发育谱系分析、PCR-RFLP(聚合酶链式反应—限制性片段长度多态性)和多重PCR 3种分子鉴定方法。系统发育谱系分析首先扩增菌株的EF-1α和Tri101 两个基因的部分序列,测序之后利用MEGA 6.06软件构建系统发育树,结果表明,有11个菌株与F. asiaticum聚在一起,37个菌株与F. graminearum sensu stricto聚为一枝,此法繁琐、复杂、成本高,但鉴定结果准确。PCR-RFLP基于组蛋白H3基因特殊的酶切位点,设计引物H3dStyI/H3R1,通过PCR和酶切反应进行鉴定,电泳检测发现,有11个菌株为F. asiaticum,37个菌株为F. graminearum sensu stricto,该法工作量大且对操作过程要求高。多重PCR基于CYP51A基因,设计特异引物FaF/FaR和FgF/FgR进行鉴定,电泳检测结果表明,有11个菌株为F. asiaticum,37个菌株为F. graminearum sensu stricto,此法操作简单、效率高。以上3种分子鉴定方法结果一致,但多重PCR方法具有快速、准确、高效的特点。

关键词: 禾谷镰刀菌复合种, Fusarium graminearum sensu stricto, Fusarium asiaticum, 分子鉴定